Akt założycielski Szkoły Podstawowej Nr 35 w Toruniu stanowi uchwała Rady Miasta Torunia z dnia 28 lipca 2011 r. To właśnie wtedy radni postanowili powołać nową szkołę, nadać jej statut i ustalić granice jej obwodu. Pierwszym Dyrektorem szkoły została Pani Małgorzata Łęc – Sienkiewicz.

Budowa szkoły rozpoczęła się w grudniu 2010 r. Wykonawcą było Przedsiębiorstwo Inwestycyjne Bud-Tech. Zakres prac obejmował budowę szkoły podstawowej wraz z przedszkolem oraz z ich pierwszym wyposażeniem. Prace budowlane zakończono w styczniu 2012 r.

Dwukondygnacyjny budynek wyposażono w sale lekcyjne, pracownie przedmiotowe, stołówkę, świetlicę, salę komputerową oraz pomieszczenia administracyjne. Na parterze usytuowano salę gimnastyczną oraz kompleks szatniowo-sanitarny. Przedszkole, zlokalizowane na parterze, posiada oddzielne wejście. W części przedszkolnej znajdują się cztery sale dydaktyczne dla poszczególnych grup wiekowych, sala rytmiczna, aula oraz stołówka. Przestronna aula ze sceną dostępna jest również dla dzieci szkolnych. Przy przedszkolu powstał plac zabaw, wyposażony w piaskownicę, drabinki, zjeżdżalnie oraz karuzelę. W 2016 r. szkoła wzbogaciła się o minipark linowy i zewnętrzną siłownię,  a w 2021 r. przedszkolny plac zabaw został zmodernizowany.

 27 lutego 2012 r. do oddziałów przedszkolnych zostały przyjęte pierwsze dzieci.

Data 3 września 2012 r. jest początkiem funkcjonowania całej placówki. To właśnie wtedy odbyła się w naszej szkole miejska inauguracja nowego roku szkolnego 2012/2013. Na uroczystości wśród licznych gości byli obecni zastępcy Prezydenta Miasta Torunia Pan Zbigniew Fiderewicz i Pan Ludwik Szuba. Naukę w Szkole Podstawowej Nr 35 rozpoczęło 118 uczniów. W szkole pracę podjęło ogółem 21 nauczycieli, w tym 6 w przedszkolu oraz 15 pracowników obsługi. Ruszyły dwa oddziały przedszkolne 6 – latków, dwie klasy pierwsze, jedna druga, jedna trzecia i jedna klasa czwarta.
Pierwsi absolwenci 6-letniej Szkoły Podstawowej Nr 35 opuścili ją w czerwcu 2015 r. Od roku szkolnego 2016/2017 placówce przewodzi Pani Dyrektor Ewa Lerman.

Dnia 23 listopada 2017 r. Rada Miasta Torunia podjęła uchwałę, na mocy której sześcioletnia Szkoła Podstawowa Nr 35 z dniem 1 września 2017 r. stała się ośmioletnią Szkołą Podstawową Nr 35 w Toruniu. Pierwsi absolwenci otrzymali świadectwo ukończenia w czerwcu 2019 r. Wtedy też po  raz pierwszy uczniowie  przystąpili do egzaminu ósmoklasisty.

Szkoła przez cały czas prężnie się rozwija. Z roku na rok powstają nowe oddziały, przybywa uczniów oraz wykwalifikowanej, ambitnej kadry pedagogicznej. Od początku jesteśmy szkołą przyjazną dzieciom, kameralną i bezpieczną, placówka oferuje bogaty wybór zajęć pozalekcyjnych, rozwija zdolności i zainteresowania, wspomaga uczniów z trudnościami i promuje zdrowy styl życia. Nasi uczniowie zaznaczają swoją obecność na mapie Torunia, osiągając znaczące sukcesy edukacyjne i sportowe.

W naszej krótkiej historii wykształciliśmy finalistów i laureatów konkursów przedmiotowych: czterech laureatów z języka polskiego (2015 r., 2016 r., 2017 r.), trzech finalistów z języka polskiego (2016 r., 2018 r.),  dwóch finalistów z matematyki (2016 r.), dwóch finalistów z języka angielskiego (2016 r., 2018 r.), jeden finalista konkursu przedmiotowego z matematyki ”Liga zadaniowa” (2016 r.).

Nasi uczniowie mogą poszczycić się również sukcesami w wielu różnorodnych konkursach np. wyróżnieniem w Międzynarodowym Konkursie „Zawsze zielono, zawsze niebiesko” (2015 r.), wyróżnieniem w ogólnopolskim konkursie „Okładki, jakże żywe”, I miejscem w V Ogólnopolskim Turnieju Superfarmera (2016 r.), wyróżnieniem w projekcie HaDwaO! organizowanym przez Galerię i Ośrodek Plastycznej Twórczości Dziecka w Toruniu (2017 r.), I miejscem w konkursie na plakat Toruńskiego Tygodnia Tolerancji (2017 r.),  III miejsce w Indywidualnych Mistrzostwach Szachowych Szkół Podstawowych Miasta Torunia (2018 r.).

Uczniowie naszej szkoły osiągają wysokie wyniki na egzaminie ósmoklasisty, plasujemy się w pierwszej dziesiątce najlepszych toruńskich szkół podstawowych.

Aktywnie bierzemy udział w życiu sportowym Torunia, odnosząc sukcesy:
– srebrny medal w rzucie piłką lekarską w Mistrzostwach Torunia Halowej Ligi Lekkoatletycznej w 2015 r. ;
– srebrny medal w rzucie piłką palantową i  brązowy medal w biegu na 60 m oraz brązowy medal w skoku w dal podczas Ligii lekkoatletycznej 2015/2016;
– srebrny medal w biegu na 60 metrów dziewcząt oraz złoty medal w skoku w dal na Indywidualnych Mistrzostwach Torunia w lekkiej atletyce w 2017 r;
– trzecie miejsce w rozgrywkach piłki ręcznej dziewcząt  Igrzysk Dzieci organizowanych przez Wydział Sportu i Rekreacji Urzędu Miasta Torunia w 2017 r.
– srebrny medal w Mistrzostwach Torunia w piłce nożnej chłopców – 2017/2018
– srebrny medal w Mistrzostwach Torunia w piłce nożnej chłopców – 2018/2019.

W dniu 29 marca 2019 r. braliśmy udział w organizacji ceremonii otwarcia Mistrzostw Świata
w Lekkiej Atletyce Masters. W imprezie wzięło udział ponad 120 uczniów naszej szkoły.
Angażujemy się w projekty edukacyjne, podnoszące jakość kształcenia, bezpieczeństwo oraz programy promujące zdrowy styl życia. Bierzemy udział w projekcie „Zdrowo jem, więcej wiem”, propagującym zbilansowane odżywianie połączone z regularną aktywnością fizyczną „Trzymaj formę!” oraz w projekcie mającym na celu bezpieczne korzystanie z zasobów cyberprzestrzeni w polskich szkołach „Cyfrowobezpieczni.pl BEZPIECZNA SZKOŁA CYFROWA”. Otrzymaliśmy certyfikat „Szkoły i przedszkola przyjaznego żywieniu i aktywności fizycznej”, certyfikat Ośrodka Rozwoju Edukacji i Centrum Edukacji Obywatelskiej „SZKOŁY GOTOWEJ NA TIK”, certyfikat  Ogólnopolskiej Inicjatywy Edukacyjnej KURSOR „WIEMY JAK! Nowe technologie w szkole”. Rozwijamy u uczniów świadomość ekologiczną, m.in. uczestniczymy w konkursie Prezydenta Miasta Torunia „Zbieramy makulaturę” i od kilku lat zajmujemy w nim czołowe miejsca. W roku szkolnym 2018/2019 zostaliśmy wyróżnieni i zaproszeni do udziału projekcie Ministerstwa Edukacji Narodowej „Godność, wolność, niepodległość”, w ramach którego realizowaliśmy szereg przedsięwzięć, uświetniających obchody 100. rocznicy odzyskania przez Polskę niepodległości: grę miejską na smartfona, międzyszkolny mityng lekkoatletyczny „Ku wolności”, lekcję muzyczną o Ignacym Janie Paderewskim, happening „Wolność kocham i rozumiem”, wycieczki szkolne, międzyszkolne konkursy literackie i konkurs plastyczny.

Na wniosek całej społeczności szkolnej dnia 28 grudnia 2017 r. Rada Miasta Torunia podjęła uchwałę o nadaniu naszej szkole imienia „Polskich Olimpijczyków”. Uroczystość z tej okazji odbyła się 23 kwietnia 2018 r. Wtedy też naszą szkołę odwiedziło wielu polskich olimpijczyków na czele z panią Ireną Szewińską, polską multimedalistką olimpijską. Społeczność Szkoły Podstawowej Nr 35 w Toruniu wybrała imię zbiorowego patrona, ponieważ  młodzież może utożsamiać się z wieloma osobami, które podziwia. Ten wybór zwraca uwagę na różnorodność i jednocześnie wyjątkowość każdego człowieka. Sportowcy uczą wytrwałości w dążeniu do celu, systematyczności, kierowania się w życiu prawdą i uczciwością oraz patriotycznych postaw. Swoją postawą uczą młode pokolenie szacunku do symboli narodowych i bycia dumnym z tego, że jest się Polakiem. Wychowanie młodzieży w oparciu o  idee olimpizmu pozwala nam kształtować ludzi wytrwałych, mądrych, a jednocześnie wrażliwych, zaangażowanych dla dobra innych i kochających swoją Ojczyznę.

Szkoła posiada swój ceremoniał, do którego należą logotyp szkoły oraz hymn szkolny. Autorem logo jest uczennica, a autorkami hymnu – nauczycielki naszej szkoły. W dniu 15 października 2021 r. szkole zostanie przekazany przez  fundatora – Radę Rodziców sztandar, który stanie się jej najważniejszym symbolem.

W roku szkolnym 2021/2022 do Szkoły Podstawowej Nr 35 im. Polskich Olimpijczyków w Toruniu uczęszcza 422 uczniów oraz 98 przedszkolaków. Kadra nauczycielska liczy obecnie 49 nauczycieli, w szkole pracuje 13 pracowników administracji i obsługi.